バイオインフォマティクス基礎スキルコースレビュー

概要

「バイオインフォマティクス基礎スキル」コースは、バイオインフォマティクスおよびデータ分析の基本的なスキルを実践的に学ぶことができるオンラインコースです。プログラミングや定量分析の背景がほとんどない生物学および生物医学の学生たちに最適です。

このコースでは、基本的なデータ分析を行うために必要な実践的スキルを開発します。特に、長期的なスキルを習得することが目的となっています。

モジュール1: Rを使ったプログラミング入門
このモジュールでは、RとRStudioを使ったプログラミングの基本を学びます。データ型、ループ、条件文などを理解し、RMarkdownを使用してコードを共有する方法を紹介します。

モジュール2: Rによるプログラミング II
論理値やベクトルの使い方をマスターし、品質管理の応用を学びます。また、基本的な統計分析を行うためのプログラミングスキルを実践します。探求的データ分析、相関関係、線形モデル、T検定、ANOVAなどが含まれています。

モジュール3: Pythonによるプログラミング入門
Pythonプログラミング言語の基本を学び、RとPythonの比較を行います。また、pandasやnumpyといった主要なPythonモジュールを使用します。

モジュール4: RNA-seqデータ分析のケーススタディ
実際のRNA-seqデータの分析に焦点を当て、Rを用いてバルクRNA-seqを分析し、Pythonで単一細胞RNA-seqを分析します。両方の解析結果を統合し、Rスキルを深化させるためのインサイトも提供されます。