Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone
최근 15년 동안 식물 생물학 분야는 흥미로운 발전들이 있었습니다. 수백 개의 식물 유전체가 시퀀싱 되었고, RNA-seq를 통해 전사체 전반의 발현 프로파일링이 가능해졌으며, 다양한 ‘-seq’ 기반 방법들이 저렴하고 고속으로 단백질-단백질 및 단백질-DNA 상호작용을 규명하게 되었습니다. 이러한 데이터 세트는 이제 마우스 클릭이나 손가락 터치로 가설을 생성할 수 있게 해줍니다.
Coursera.org에서 제공되는 ‘Plant Bioinformatics’ 과정에서는 33가지 식물 전용 자료를 통해 심도 있는 교육을 받을 수 있습니다. 이 과정을 수강하며 각 모듈을 통해 식물 생물정보학의 핵심 개념을 배울 수 있습니다.
주요 학습 내용:
- 관심 유전자 탐색: 1주차 모듈에서는 서울대학교의 Arabidopsis에서 유래한 관심 유전자 At3g20300을 예로 들어 온라인 데이터베이스를 활용하여 해당 유전자에 대한 정보(크기, 유사 유전자, 계통학적 관계 등)를 수집하는 방법을 배웁니다.
- 관심 유전자 관련 유전자 식별: 공발현 분석을 통해 기능이 알려지지 않은 유전자의 기능을 추론해보는 과정입니다. 공발현 유전자의 프로모터에 공통적인 조절 모티프가 있는지 조사해보는 것도 포함됩니다.
- 유전자 네트워크 분석: 공발현 유전자의 유전자 온톨로지 부여 분석을 통해 유전자의 기능을 추론하는 방법을 배웁니다. 네트워크 도구를 활용하여 더 많은 유전자 연결성을 탐구하게 됩니다.
- 랩 리포트 작성: 그동안의 분석을 바탕으로 관심 유전자의 잠재적 기능을 서술하는 초안 리포트를 작성하고, 피어 리뷰를 통해 최종 리포트를 작성합니다.
이 과정은 생물정보학에 관심이 있는 분들에게 매우 유용하며, 실제 데이터 작업을 통해 이론과 실습을 결합할 수 있는 기회를 제공합니다. 데이터베이스와 다양한 분석 도구를 활용하여 정보를 수집하고 분석하는 기술을 함께 배울 수 있어, 생물학적 연구에 한걸음 더 나아갈 수 있습니다.
결론적으로, ‘Plant Bioinformatics Capstone’ 과정은 식물 생물학과 생물정보학 간의 경계를 허물며, 깊이 있는 지식을 습득하고 실질적인 분석 경험을 통해 그 기반을 다질 수 있는 기회를 제공합니다. 초심자는 물론, 연구 중인 분들께도 강력히 추천드립니다!
Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone