Tag: ゲノムデータ

Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/bioconductor はじめに 最近、ゲノムデータの分析に興味を持ち始めました。そんな中、Courseraで提供されている「Bioconductor for Genomic Data Science」というコースを見つけました。これは、ジョンズ・ホプキンズ大学が提供する「Genomic Big Data Specialization」の一環であり、非常に興味深い内容でした。このブログでは、このコースの内容や魅力を詳しく紹介し、皆さんにおすすめしたいと思います。 コースの概要 このコースでは、Bioconductorプロジェクトのツールを使用して、ゲノムデータの分析を行う方法を学びます。産業界でも広く使用されているR言語を用いた実践的な内容が多く、データサイエンスのスキルを高められます。 シラバス 第1週:この週では、Bioconductorソフトウェアのインストールと使用方法を学びます。ExpressionSets、SummarizedExperiment、GRangesなど、さまざまな種類の分析で使用される一般的なデータ構造について学びます。 第2週:生物学的配列を全ゲノムレベルや数百万の短鎖リードレベルで表現し、計算する方法を学びます。 第3週:基本的なデータ型、ExpressionSet、biomaRt、R S4について学びます。 第4週:Bioconductorでデータを取り込む方法や、Rsamtools、oligo、limma、minfiなどについて学びます。 コースを受けた感想 このコースは、実際に手を動かしながら学べるためとても良い経験になりました。特に、各週に設定された演習課題は、理論だけでなく実践的なスキルを身につけるのに役立ちました。データ構造や分析方法について深く理解できたことで、今後の研究や実務に大いに役立つと感じています。 おすすめの理由 このコースは、ゲノムデータ分析を学びたい人にとって非常に有益です。特に、R言語に触れる機会が多く、将来的にデータサイエンスの分野で活躍したいと考えている方には強くおすすめしたいです。 まとめ 「Bioconductor for Genomic Data Science」は、ゲノムデータの分析方法を学ぶための素晴らしいコースです。これからの研究やキャリアに役立つスキルを身につけたい方は、ぜひ受講してみてください。…