Tag: シーケンシング

メタゲノミクス:病原体監視と抗菌薬耐性の新しい視点

Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/metagenomics 今日はCourseraの「メタゲノミクス:病原体の監視と抗菌薬耐性に応用」というコースを紹介したいと思います。このコースは、メタゲノミクスと全体コミュニティシーケンシングの分野を探求し、微生物コミュニティの内容とそれが人間の病気や抗菌薬耐性とどのように関連しているかを解明するためのものです。 このコースには、メタゲノミクスデータを理解するためのバイオインフォマティクスツールがどれほど重要であるかが強調されています。複雑なサンプルにおける病原体と抗菌薬耐性因子の存在を推定するために、これらのツールは不可欠です。また、関連する説明データと組み合わせることで、メタゲノミクスは監視のための強力な手段となります。 コースの内容は以下のような構成になっています: サンプリングからシーケンシング:メタゲノミクスの基本を学び、サンプリングプランやサンプル取り扱いの考慮事項を理解します。 リードから結果へ:バイオインフォマティクスデータの解析基礎と、質の管理、MGmapper、KRAKEN、ResFinderなどの使用を学びます。 結果の解釈と監視へのメタゲノミクスの可能性:シーケンスリードの解析手法や、メタゲノミクスを用いたグローバルな監視の可能性を探ります。 このコースは初心者から中級者まで、バイオインフォマティクスやメタゲノミクスに興味がある方に特におすすめです。特に、感染症や抗菌薬耐性に関連する研究を行っている方には、実用的で深い知識を得る良い機会になるでしょう。 ぜひ受講してみてください! Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/metagenomics

DNAシーケンシングのためのアルゴリズムコースレビュー

Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/dna-sequencing こんにちは!今日はCourseraで提供されている「DNAシーケンシングのためのアルゴリズム」についてのレビューをお届けします。このコースでは、DNAシーケンシングデータを分析するための計算的方法、すなわちアルゴリズムとデータ構造について学ぶことができます。私たちはPythonを使って、DNA解析に関連するさまざまなアルゴリズムを実装し、実際のゲノムやDNAシーケンシングデータセットを分析します。 コースは以下のモジュールから成り立っています: 1. **DNAシーケンシング、文字列とマッチング** – このモジュールでは、DNAシーケンシング技術の過去と現在、そしてその働きについて学びます。 2. **前処理、インデクシング、近似マッチング** – Boyer-Mooreアルゴリズムを使って、正確なマッチングを行うための効率的なアルゴリズムを学びます。 3. **編集距離、アセンブリ、オーバーラップ** – 読み取りアライメントについての議論を終え、編集距離問題や関連する生物配列分析問題について学びます。 4. **アセンブリのためのアルゴリズム** – アセンブリ問題の解決方法を深掘りしていきます。 このコースは、バイオインフォマティクスや計算生物学に興味のある方に特にお勧めです。プログラミングの経験があれば、Pythonを使って実際のデータセットに基づいた実践的なスキルを身につけることができます。また、アルゴリズムに関する知識を深めることで、科学技術の進歩に寄与できる可能性もあります。 最後に、実践的な内容も多く、自己学習を促進する環境が整っているため、忙しい方でも取り組みやすいコースだと思いました。興味がある方は、ぜひ受講を検討してみてください! Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/dna-sequencing