プラント・バイオインフォマティクス・キャップストーンコースレビュー
Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone はじめに 植物生物学の分野は、過去15年間で驚くべき進展を遂げてきました。多くの植物ゲノムが配列決定され、RNAシーケンスによって網羅的な発現プロファイリングが可能となり、さまざまな-シーケンス法が高スループットでのタンパク質-タンパク質およびタンパク質- DNA相互作用の決定を可能にしました。このような膨大なデータを活用して、我々は簡単に仮説を生成することができます。 コースの概要 Courseraで提供されている「プラント・バイオインフォマティクス」では、33の植物特有のトピックについて学びます。本コースでは、自分の興味のある遺伝子をオンラインデータベースを用いて探求することから始まり、相関関係のある遺伝子の同定、機能分析、そして最終的なラボレポートの作成に至ります。 カリキュラムの特徴 オンラインデータベースによる遺伝子の探求第一週では、アラビドプシスの「At3g20300」というあまり知られていない遺伝子を例に、オンラインデータベースを活用してその遺伝子についての情報を収集します。遺伝子のサイズ、相同遺伝子、系統関係、ドメイン情報、サブセルラー局在などの情報を集める方法を学びます。 興味のある遺伝子に関連する遺伝子の特定未知の機能を持つ遺伝子と共発現する遺伝子の機能を理解することで新しい遺伝子を同定するための分析手法を学習します。 遺伝子ネットワークと機能分析共発現遺伝子群に対して遺伝子オントロジーの富豪分析を行うことで、遺伝子の機能を推測します。この過程で、遺伝子同士のさらなる関連性を探求します。 ラボレポートの作成これまでの分析結果を基に、遺伝子の推定機能についてのラボレポートを作成します。ピアレビューを受けて、最終的なレポートを完成させます。 総評 このコースは、植物生物学におけるバイオインフォマティクスの基礎から応用までを学べる貴重な機会です。独自の研究を進める上で必要なスキルと知識を身に付けることができ、特に生物科学に興味のある方には強くお勧めしたい内容です。 Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone