遺伝子組み立てプログラミングチャレンジコースレビュー
Enroll Course: https://www.coursera.org/learn/assembling-genomes はじめに みなさん、こんにちは！今日はCourseraで提供されている「Genome Assembly Programming Challenge」についてご紹介したいと思います。このコースは、2011年にドイツで発生した致死的なE. coli感染症のアウトブレイクを通じて、遺伝子組み立てのプログラミングを学ぶ機会を提供します。 コース概要 このコースは、何千人もの人々が食中毒で入院し、最終的に53人が命を落とすという事件から始まります。生物学者たちは、この新しい病原体がどのように遺伝子を獲得したのかを解明するために、E. coli Xのゲノムシーケンスを特定するという重大な課題に取り組みます。 シラバス このコースは次のような構成になっています： 2011年のヨーロッパE. coliアウトブレイク – アウトブレイクの背景と生物情報学者たちの役割を学びます。 de Bruijnグラフを使ったゲノムの組み立て – DNA配列決定のアルゴリズム的課題について詳しく学び、自分でウイルスのゲノムを組み立てます。 リアルなシーケンシングデータに基づくゲノムの組み立て – 現代のシーケンシング技術の課題を理解し、小さな細菌のゲノムを組み立てた後、最終的にはE. coli Xのゲノム構築に挑戦します。 おすすめポイント このコースは、実際のアウトブレイク事件と関連させながら学ぶことができ、生物情報学におけるプログラミング技能だけでなく、問題解決能力も高めることができます。また、仲間と知識を共有することができるフォーラムも用意されており、より深い理解を助けてくれます。…